这首诗描绘了诗人病中登高望远的情景，充满了深沉的秋意与淡淡的忧愁。首联“病里独登楼，楼前古寺秋”开篇即点明了诗人身体不适，独自登楼，楼前古寺正值秋色，营造出一种孤寂而萧瑟的氛围。颔联“霜寒红叶径，雨过白蘋洲”进一步渲染了秋日的景象，霜寒使得红叶更加鲜艳，雨后的白蘋洲则显得格外清新，两幅画面相得益彰，展现了自然界的美丽与宁静。
颈联“药裹随身好，诗怀到处幽”转而写到诗人随身携带的药囊和内心的诗意，即使在病中，诗人的精神世界依然丰富，对生活的热爱并未因疾病而消减。尾联“明朝欲归去，又上木兰舟”表达了诗人对未来的期待与矛盾，他渴望归家，却又在心中勾勒出再次登舟远行的画面，这种情感的交织，使得整首诗充满了深邃的意境和情感的张力。
综观全诗，秦仲锡以细腻的笔触描绘了病中登楼所见之景，以及由此引发的内心感受，既展现了自然之美，也反映了诗人复杂的情感状态，是一首富有哲思与艺术感染力的作品。
