这首诗描绘了小孤山的壮丽景色与神秘氛围。开篇“砥柱从开辟，中流自古今”以“砥柱”象征山峰屹立不倒，历经岁月变迁，展现出山的坚韧与永恒之美。接着“神龙常在窟，怪木不成林”则通过想象中的神龙与奇异树木，营造出一种超凡脱俗、充满神话色彩的意境。诗人进一步描绘山峰之巅云雾缭绕，仿佛流动的光影，悬崖之上，鸟儿掠过，留下悠长的回音，将自然的静谧与生机巧妙结合。
最后，“吾题百丈壁，仙迹倘相寻”表达了诗人对自然美景的赞叹以及对可能隐藏于山壁之中的仙人遗迹的向往和探索之心。整首诗不仅展现了小孤山的自然景观之美，也融入了诗人对未知世界的好奇与追求，体现了明代文人对自然的热爱与敬畏之情。
