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这首诗描绘了一幅静谧而深远的山中景象，通过对自然景物的描述，表达了诗人对于岁月流转、人事变迁以及禅学修持的独特感悟。

"松树有死枝，冢上唯莓苔。石门无人入，古木花不开。" 这几句描绘了一种幽静萧瑟的景象，松树枯死、墓地覆盖着低矮的野草，这些都是时间流逝和生命消亡的象征。而石门紧闭，没有人迹，古木也不再开花，给人一种时间似乎停止了流动的感觉。

"绿竹岁寒在，故人衰老多。月色静中见，泉声深处闻。" 绿竹依旧，但岁月的冷酷让曾经熟悉的人变得衰老。这两句通过对比，表达了时间对自然和人类生命的不同影响，同时月光和泉水的声音在静谧中显得更加清晰，仿佛是超越尘世变化的永恒存在。

"古观茅山下，诸峰欲曙时。真人是黄子，玉堂生紫芝。禅门至六祖，衣钵无人得。" 这几句提到了“茅山”和“黄子”，都与道教有关，可能暗示诗人对道家修炼的向往。而“玉堂生紫芝”则是仙境美好的象征，表达了对超凡脱俗境界的向往。接着，“禅门至六祖”指的是佛教禅宗，由印度传入中国，历经多代传承到惠能六祖，这里强调的是禅学的高深和纯粹。而“衣钵无人得”则表现了对禅学修持的艰难和稀少有人能够真正领悟。

"古墓碑表折，荒垄松柏稀。秋深知气正，家近觉山寒。" 古墓的碑石破损，荒废的丘陵上零星分布着松柏，这些都是时间流逝和历史遗迹的象征。而“秋深知气正”则表达了对季节更迭中自然规律的理解和接受，同时也反映出诗人对于家园的亲近感受到了山中的寒冷。

"山僧不记重阳日， 因见茱萸忆去年。今非古狱下，莫向斗边看。海月生残夜，江春入暮年。" 山中僧人已经忘记了过往的重阳节气，只是在看到秋天的茱萸时才想起过去。此刻的世界已经不同于从前，不应再向星辰中的斗宿所在处寻找旧日的影踪。海边的月亮出现在夜晚的尾声，江上的春色逐渐融入年华的暮年，这些都是对时间流逝和生命消长的深刻感悟。

"窗风枯砚水，山雨慢琴弦。" 最后两句则是诗人在描绘自己的生活状态：窗外的风吹得桌上的砚台干涸，而山中的雨声似乎与缓慢地拨动琴弦相呼应。这不仅形象地表达了诗人的内心世界，也是对自然界和个人情感的深刻把握。

整首诗通过对自然景物的细腻描写，展现了一种超脱尘世、淡泊明志的生活态度，同时也透露出诗人对于时间流逝和生命价值的深刻思考。