这首诗描绘了一幅静谧而充满禅意的海上寺院景象。首句“丹阁藏山翠”，以“丹阁”点出寺院建筑的红墙金瓦，与“山翠”相映成趣，展现出一种庄严而又清新的氛围。接着，“深林独步馀”则描绘了诗人独自漫步于寺院周围的幽深林间，营造出一种远离尘嚣的宁静感。
“鸟喧侵佛座，蜃吐捧禅居”两句运用拟人化的手法，生动地描绘了自然界的生灵与寺院的和谐共存。鸟儿的鸣叫似乎直接侵入了佛座，而蜃（一种传说中的生物）吐出的云气仿佛在捧托着禅居，进一步强化了寺院与自然界的紧密联系和和谐共生的意境。
“蓑脱朝耕罢，鱼敲夜梵初”则通过农夫脱下蓑衣结束劳作和夜晚僧侣敲击木鱼开始诵经的场景，展现了寺院生活的日常性和宗教活动的庄严性。这两句不仅描绘了时间的流转，也暗示了寺院不仅是僧侣修行的地方，也是与世俗生活紧密相连的场所。
最后，“山扉谁为守，麋鹿卧前除”以山门为背景，以麋鹿悠闲地卧在门前作为结尾，既体现了寺院环境的自然与和谐，也寓意着佛法的广大与包容，任何生命都能在此找到安宁之所。
整体而言，这首诗通过对海上寺院及其周围环境的细腻描绘，展现了佛教文化的深远影响以及与自然界的和谐共生，同时也传达了对宁静、和谐生活的向往。
