这首诗描绘了万年寺的自然风貌和宁静氛围。首句“万年山木有千年”强调了寺庙所在之地的古老与沧桑，山中树木历经千年岁月。接下来的“石路阴深到缭垣”描绘了蜿蜒曲折的石径通向隐秘的寺墙，营造出一种幽深寂静的环境。
“几片云闲谁是主”运用拟人手法，暗示云彩在山间悠然飘荡，无人能主宰，增添了神秘感。而“一条流水不知源”则进一步渲染了山林的深远和自然的神秘莫测。诗人通过“土栽芍药尤胜木”表达了对寺内种植的芍药的喜爱，它们比寻常树木更显娇艳。
“僧说猕猴极畏猿”插入了一段僧人的讲述，增添了生活气息，也反映出山中动物生态的奇特。最后，“夜半空堂诸境寂，微闻钟梵亦成喧”描述了夜晚寺庙的静谧，只有远处传来的钟声打破了这份宁静，反而显得更加热闹。
整体来看，赵师秀的《万年寺》以细腻的笔触描绘了山寺的自然景观和禅意氛围，展现了诗人对古寺生活的独特感受。
