此联描绘了淮渎庙内两幅生动的神话场景，以丰富的想象力展现了古代人们对自然力量与神灵信仰的独特理解。
上联“巫支祈井底深潜，澜恬洪泽”中，“巫支祈”是古代神话中的水怪，传说能兴风作浪，危害人间。此处描述其在井底深潜，使得水面平静，洪泽得以安抚，象征着通过智慧与力量，能够控制和调和自然界的动荡，带来安宁。
下联“阿罗汉波间重出，福佑清淮”则转向了佛教元素，提到“阿罗汉”是佛教中修行达到最高境界的圣者，他们能够超脱生死，普渡众生。此处意指阿罗汉在波涛之间再次显现，为清淮带来了福祉与保护，寓意着宗教信仰的力量能够净化人心，带来祥和与幸福。
整联通过对比神话与佛教的元素，既展现了对自然力量的敬畏，也表达了人类对于和谐共存、心灵纯净的追求。
